La Sophienkirche s'élève en retrait de la Grosse Hamburger Strasse, derrière un pittoresque portail en fer forgé, qui marque le début d'un étroit passage entre de vieux immeubles. L'église Sainte Sophie est la seule des églises de Berlin à n'avoir subi aucun dommage au lendemain de la seconde guerre mondiale.

Cette église baroque fut commandée en 1712 par la princesse Sophie Louise, épouse de Frédéric I. La Sophienkirche constituait à l'époque la première église du nouveau faubourg de Spandauer Vorstadt.

L'architecte Johann Friedrich Grael dota l'édifice de sa tour entre 1729 et 1735.

Un presbytère, de style néo-baroque, fut construit en 1892, mais ne vint pas rompre l'harmonie baroque de l'église. A l'occasion de ces travaux de construction la Sophienkirche fut rénovée, mais a conservé de nombreux éléments d'origine, en particulier les fonts baptismaux et la chaire. L'orgue date de 1789.

Un petit cimetière borde le sanctuaire et présente encore de nombreuses pierres tombales du XVIIIe siècle. Parmi les personnages illustres à reposer dans ce cimetière figurent Karl Friedrich Zelter, directeur de l'Académie de Chant de Berlin, Anna Louise Karsch, poétesse alias la "Sapho allemande", Leopold von Ranke, historien du XIXe siècle.